Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
UPB1Q9UBR1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UPB1Q9UBR1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UPB1Q9UBR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UPB1Q9UBR1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms