Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DNMT3BQ9UBC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DNMT3BQ9UBC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DNMT3BQ9UBC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT3BQ9UBC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DNMT3BQ9UBC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms