Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IGSF9Q9P2J2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IGSF9Q9P2J2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGSF9Q9P2J2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGSF9Q9P2J2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGSF9Q9P2J2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms