Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP36Q9P275 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP36Q9P275 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP36Q9P275 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP36Q9P275 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms