Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ABRACLQ9P1F3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ABRACLQ9P1F3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABRACLQ9P1F3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms