Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAPAQ9P0L0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VAPAQ9P0L0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VAPAQ9P0L0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VAPAQ9P0L0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VAPAQ9P0L0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms