Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HACD3Q9P035 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HACD3Q9P035 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HACD3Q9P035 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms