Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI5

GRHL1, Grainyhead-like protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL1Q9NZI5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRHL1Q9NZI5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GRHL1Q9NZI5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GRHL1Q9NZI5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRHL1Q9NZI5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GRHL1Q9NZI5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms