Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREM2Q9NZC2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TREM2Q9NZC2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREM2Q9NZC2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TREM2Q9NZC2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TREM2Q9NZC2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TREM2Q9NZC2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TREM2Q9NZC2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms