Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBAP1Q9NZ09 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBAP1Q9NZ09 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBAP1Q9NZ09 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBAP1Q9NZ09 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms