Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXC10Q9NYD6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXC10Q9NYD6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXC10Q9NYD6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXC10Q9NYD6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXC10Q9NYD6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms