Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC39A1Q9NY26 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC39A1Q9NY26 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A1Q9NY26 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A1Q9NY26 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms