Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
OXSMQ9NWU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
OXSMQ9NWU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OXSMQ9NWU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OXSMQ9NWU1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OXSMQ9NWU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms