Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MED9Q9NWA0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED9Q9NWA0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MED9Q9NWA0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MED9Q9NWA0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MED9Q9NWA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms