Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FANCLQ9NW38 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
FANCLQ9NW38 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FANCLQ9NW38 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FANCLQ9NW38 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCLQ9NW38 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCLQ9NW38 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms