Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPMQ9NSP4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CENPMQ9NSP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPMQ9NSP4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPMQ9NSP4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms