Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GKN1Q9NS71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GKN1Q9NS71 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GKN1Q9NS71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GKN1Q9NS71 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GKN1Q9NS71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms