Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KCNIP2Q9NS61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KCNIP2Q9NS61 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KCNIP2Q9NS61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KCNIP2Q9NS61 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms