Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HELLSQ9NRZ9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
HELLSQ9NRZ9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
HELLSQ9NRZ9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HELLSQ9NRZ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELLSQ9NRZ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELLSQ9NRZ9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELLSQ9NRZ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
HELLSQ9NRZ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELLSQ9NRZ9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms