Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PLSCR3Q9NRY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLSCR3Q9NRY6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PLSCR3Q9NRY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms