Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLE3Q9NRF9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
POLE3Q9NRF9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLE3Q9NRF9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLE3Q9NRF9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms