Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARHGEF3Q9NR81 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF3Q9NR81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ARHGEF3Q9NR81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARHGEF3Q9NR81 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARHGEF3Q9NR81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms