Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM138Q9NPI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM138Q9NPI0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TMEM138Q9NPI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.8 ms