Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNK9Q9NPC2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KCNK9Q9NPC2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNK9Q9NPC2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNK9Q9NPC2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2017.9 ms