Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA3

MID1IP1, Mid1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID1IP1Q9NPA3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MID1IP1Q9NPA3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MID1IP1Q9NPA3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID1IP1Q9NPA3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID1IP1Q9NPA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms