Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDE7BQ9NP56 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDE7BQ9NP56 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDE7BQ9NP56 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE7BQ9NP56 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms