Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
VAT1LQ9HCJ6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VAT1LQ9HCJ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VAT1LQ9HCJ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAT1LQ9HCJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAT1LQ9HCJ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms