Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF556Q9HAH1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF556Q9HAH1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF556Q9HAH1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF556Q9HAH1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms