Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN28AQ9H9Z2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LIN28AQ9H9Z2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN28AQ9H9Z2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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