Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CATSPERBQ9H7T0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CATSPERBQ9H7T0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CATSPERBQ9H7T0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CATSPERBQ9H7T0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CATSPERBQ9H7T0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CATSPERBQ9H7T0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CATSPERBQ9H7T0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CATSPERBQ9H7T0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms