Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C8orf33Q9H7E9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C8orf33Q9H7E9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
C8orf33Q9H7E9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C8orf33Q9H7E9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
C8orf33Q9H7E9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
C8orf33Q9H7E9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
C8orf33Q9H7E9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8orf33Q9H7E9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
C8orf33Q9H7E9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C8orf33Q9H7E9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms