Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM38AQ9H6F2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM38AQ9H6F2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM38AQ9H6F2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM38AQ9H6F2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms