Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D3

XKR8, XK-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR8Q9H6D3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XKR8Q9H6D3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
XKR8Q9H6D3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
XKR8Q9H6D3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
XKR8Q9H6D3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms