Protein–RNA interactions for Protein: Q9H446

RWDD1, RWD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD1Q9H446 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RWDD1Q9H446 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
RWDD1Q9H446 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
RWDD1Q9H446 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RWDD1Q9H446 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
RWDD1Q9H446 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RWDD1Q9H446 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms