Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0U4

RAB1B, Ras-related protein Rab-1B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1BQ9H0U4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB1BQ9H0U4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB1BQ9H0U4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB1BQ9H0U4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB1BQ9H0U4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB1BQ9H0U4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms