Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K1

SIK2, Serine/threonine-protein kinase SIK2, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK2Q9H0K1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SIK2Q9H0K1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SIK2Q9H0K1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK2Q9H0K1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIK2Q9H0K1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK2Q9H0K1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms