Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SENP6Q9GZR1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SENP6Q9GZR1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SENP6Q9GZR1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SENP6Q9GZR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms