Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP2Q9C0B6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BRINP2Q9C0B6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRINP2Q9C0B6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRINP2Q9C0B6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.3 ms