Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXQ1Q9C009 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXQ1Q9C009 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXQ1Q9C009 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXQ1Q9C009 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXQ1Q9C009 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
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