Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PITPNM3Q9BZ71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PITPNM3Q9BZ71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PITPNM3Q9BZ71 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PITPNM3Q9BZ71 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms