Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM34Q9BYJ4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM34Q9BYJ4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM34Q9BYJ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TRIM34Q9BYJ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM34Q9BYJ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms