Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RSPO3Q9BXY4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RSPO3Q9BXY4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RSPO3Q9BXY4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RSPO3Q9BXY4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RSPO3Q9BXY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms