Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CALN1Q9BXU9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CALN1Q9BXU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CALN1Q9BXU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CALN1Q9BXU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms