Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SSBP4Q9BWG4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP4Q9BWG4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSBP4Q9BWG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSBP4Q9BWG4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms