Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV20

MRI1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRI1Q9BV20 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MRI1Q9BV20 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRI1Q9BV20 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MRI1Q9BV20 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MRI1Q9BV20 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms