Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NDUFAF3Q9BU61 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NDUFAF3Q9BU61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms