Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRFN3Q9BTN0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRFN3Q9BTN0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRFN3Q9BTN0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LRFN3Q9BTN0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LRFN3Q9BTN0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms