Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NICN1Q9BSH3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NICN1Q9BSH3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NICN1Q9BSH3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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