Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CITED1Q99966 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CITED1Q99966 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CITED1Q99966 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms