Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDNQ99608 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDNQ99608 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NDNQ99608 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDNQ99608 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDNQ99608 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDNQ99608 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDNQ99608 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDNQ99608 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDNQ99608 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NDNQ99608 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDNQ99608 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDNQ99608 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDNQ99608 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDNQ99608 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDNQ99608 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDNQ99608 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NDNQ99608 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDNQ99608 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDNQ99608 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDNQ99608 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDNQ99608 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDNQ99608 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDNQ99608 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDNQ99608 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
NDNQ99608 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NDNQ99608 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDNQ99608 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDNQ99608 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDNQ99608 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NDNQ99608 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDNQ99608 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDNQ99608 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDNQ99608 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDNQ99608 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDNQ99608 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDNQ99608 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDNQ99608 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDNQ99608 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDNQ99608 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDNQ99608 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDNQ99608 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NDNQ99608 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDNQ99608 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDNQ99608 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDNQ99608 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDNQ99608 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDNQ99608 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDNQ99608 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDNQ99608 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDNQ99608 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDNQ99608 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDNQ99608 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDNQ99608 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDNQ99608 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDNQ99608 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDNQ99608 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDNQ99608 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDNQ99608 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDNQ99608 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDNQ99608 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDNQ99608 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDNQ99608 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDNQ99608 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDNQ99608 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDNQ99608 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDNQ99608 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDNQ99608 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDNQ99608 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDNQ99608 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDNQ99608 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDNQ99608 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDNQ99608 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDNQ99608 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDNQ99608 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NDNQ99608 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDNQ99608 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDNQ99608 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDNQ99608 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDNQ99608 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDNQ99608 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDNQ99608 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDNQ99608 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDNQ99608 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms